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Hadoop-HDFS 对性能造成重大影响的神秘杀手-Shell.

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关于想了解HDFS的源码的朋友, 可以到蔡斌大哥那读读他的javaeye.

很抱歉, 我用了神秘杀手一词, 因为它实在害我太惨, 又花了好大精力才把它给拎出来。 

近来在测试Hadoop时, 使用NameNode身上的dfshealth.jsp 管理页面发现,DataNode在运行的过程中, Last Contact 参数时常会超过3。LC(Last Contact)的意思是表明DataNode有多少秒的时间未向NameNode发送心跳包了. 然而默认DataNode是3秒发送一次, 我们都知道,NameNode默认以10分钟作为DN的死亡超时时间,那么究竟有哪些因素会导致JSP管理页面LC参数超过3,甚至会达到200以上,这样的情况对我们的系统的稳定运行究竟有没有影响?
事实上,这现象我观察了好一阵子,影响LC参数增大的原因有下面几种情况:

1. HDFS收到大量删除BLOCK的命令. 请参见:https://issues.apache.org/jira/browse/HDFS-611
2. HDFS 有大量BLOCK需要report 给NN;
3. 组织心跳包的数据;
4. 网络环境。

前两种情况LC的值一般不会超过100,对性能不会造成很大影响。 Hadoop-0.22.0 以后版本,Hadoop也有所改进。

那么值的一提的是DN在组织心跳包期间,对FSDatasetInterface 接口进行了相关方法的调用,具体可以参考一下FSDatasetMBean接口中的几个方法:
/**
   * Returns the total space (in bytes) used by dfs datanode
   * @return  the total space used by dfs datanode
   * @throws IOException
   */  
  public long getDfsUsed() throws IOException;
    
  /**
   * Returns total capacity (in bytes) of storage (used and unused)
   * @return  total capacity of storage (used and unused)
   * @throws IOException
   */
  public long getCapacity() throws IOException;

  /**
   * Returns the amount of free storage space (in bytes)
   * @return The amount of free storage space
   * @throws IOException
   */
  public long getRemaining() throws IOException;


这三个方法意思大家都很明白,它们的实现者分别为DF,DU两个类,它们会不定期的通过Shell类的runComamnd方法来执行系统命令,以获取当前目录的 df, du 值。
然而在执行的过程当中有趣的事情发生了,笔者有13个分区,一共存有14万多个BLOCK,
Df 和du 平均每次执行的时间都会超过两秒,戏剧性的是DU 和DF最高的一次在执行某分区目录的命令时,居然用了180秒以上。(Shell#runCommand方法中, 从ProcessBuilder 实例化到process.start() 执行时间)。

难道是分区目录下的BLOCK数量过多导致运行缓慢么,在linux 系统里执行DF DU相同的命令结果都是以毫秒时间结束。那问题显然出在了ProcessBuilder, 居了解,该类由JVM通过Linux 内核来fork 子进程,子进程当然会完全继承父进程的所有内存句柄,jstack看到JVM此时线程状态大部分处于WAITING, 这个过程经过测试确实会影响DFSClient写入超时,或关闭流出错(下篇会说到, 作为长久Running 的DFSClient, 应该做好流的关闭工作,0.21-trunk中流的关闭仍然存有安全隐患。) 最后我折腾过从32位机子一路换到64位的机子,但问题依然存在。

最后只好再次对HDFS开刀,重构了DU,DF 以及自己的IOStat , Uptime类,通过Linux系统来执行,把结果输出到临时文件中,然后由Hadoop来读取。 LC的问题不再发生。 当然有朋友遇到过,并且有解决方案的可以联系我 dongtalk@gmail.com .
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评论
7 楼 xiaoyao3857 2012-08-24  
看看你们的评论,收获不比看资料、正文收获小啊
6 楼 lance_123 2011-01-04  
david.org 写道
lance_123 写道
david.org 写道
lance_123 写道
这就是Java语言所带来的缺点的地方。


呃... 这个问题后来还是有了结论,我咨询过淘宝与腾讯,他们确实在DU,DF方面没有遇到我这样的问题。

问题的根源还是在于我在Datanode上使用了RAID阵列,导致磁盘IO的吞吐量大大降低。 从而在DU与DF过程中,导致系统IOWait激增。

哦,原来是这样的啊,DN上一般没必要使用阵列吧?为了节省空间?


嗯,是的。 让RAID保持两份副本,再使用非RAID硬盘保存一份。 在这样的情况下,不知道你有啥好的想法没?

其实只有二个副本,一个用RAID来维持,一个用非RAID来保存,多个DN共用阵列?你们数据量很大了?其实如果阵列失效很危险,还不如在上层采用RAID形式,DN中还是用JBOD,facebook是采用这种方法来保存历史且访问不频繁的数据。
5 楼 david.org 2011-01-04  
lance_123 写道
david.org 写道
lance_123 写道
这就是Java语言所带来的缺点的地方。


呃... 这个问题后来还是有了结论,我咨询过淘宝与腾讯,他们确实在DU,DF方面没有遇到我这样的问题。

问题的根源还是在于我在Datanode上使用了RAID阵列,导致磁盘IO的吞吐量大大降低。 从而在DU与DF过程中,导致系统IOWait激增。

哦,原来是这样的啊,DN上一般没必要使用阵列吧?为了节省空间?


嗯,是的。 让RAID保持两份副本,再使用非RAID硬盘保存一份。 在这样的情况下,不知道你有啥好的想法没?
4 楼 lance_123 2011-01-03  
david.org 写道
lance_123 写道
这就是Java语言所带来的缺点的地方。


呃... 这个问题后来还是有了结论,我咨询过淘宝与腾讯,他们确实在DU,DF方面没有遇到我这样的问题。

问题的根源还是在于我在Datanode上使用了RAID阵列,导致磁盘IO的吞吐量大大降低。 从而在DU与DF过程中,导致系统IOWait激增。

哦,原来是这样的啊,DN上一般没必要使用阵列吧?为了节省空间?
3 楼 david.org 2011-01-03  
lance_123 写道
这就是Java语言所带来的缺点的地方。


呃... 这个问题后来还是有了结论,我咨询过淘宝与腾讯,他们确实在DU,DF方面没有遇到我这样的问题。

问题的根源还是在于我在Datanode上使用了RAID阵列,导致磁盘IO的吞吐量大大降低。 从而在DU与DF过程中,导致系统IOWait激增。
2 楼 lance_123 2011-01-03  
这就是Java语言所带来的缺点的地方。
1 楼 caibinbupt 2010-03-30  
顶,这个结论来得不容易

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